Siedziba gminy, położona jest w jej centralnej części, nad rzeką Siniochą, w obrębie Padołu Zamojskiego.
Pierwsza wzmianka źródłowa o Miączynie pochodzi z roku 1394, kiedy został wymieniony w nowo powstałej parafii łacińskiej w Grabowcu. Z 1472 roku pochodzi wzmianka o cerkwi w Miączynie. Do 1462 roku był wsią książęcą, a po włączeniu księstwa bełskiego do Korony został wsią królewską. W 1622 roku w Miączynie był dwór, prawdopodobnie murowany.
W 1630 roku Miączyn nawiedziło „gwałtowne morowe powietrze”, które wyludniło wieś. Spis z 1827 roku notował Miączyn w powiecie hrubieszowskim i parafii Grabowiec. Liczył wówczas 78 domów i 570 mieszkańców.

W 1918 roku cerkiew rekoncyliowano na kościół katolicki. Pod koniec XIX wieku w Miączynie były dwa młyny wodne i dwie karczmy. Działania wojenne w 1915 roku objęły także okolice Miączyna. Zanotowano tu poważne straty, a wśród wielu domów spłonęły również budynki szkoły i Urzędu Gminy. Według spisu z 1921 roku wieś liczyła 151 domów i 1095 mieszkańców.
Bardzo ważną inwestycją okresu międzywojennego dla gminy Miączyn była budowa w 1916 roku linii kolejowej Zawada-Włodzimierz Wołyński oraz budowa drogi Zamość-Hrubieszów w 1939 roku. Podobnie jak w innych wioskach podczas II wojny światowej w Miączynie doszło  do kilku akcji partyzanckich.

W dniu 22 lipca 1943 roku Miączyn został wysiedlony przez Niemców, którzy w miejsce Polaków zasiedlili kolonistów z Jugosławii, Rumunii i Bułgarii. Po wyzwoleniu życie zaczęło wracać do normy. W 1948 roku uruchomiono w remizo-świetlicy kino „Wiarus”, w tym samym roku utworzono Gminną Spółdzielnię „Samopomoc Chłopska”.

W latach 1979-1982 obok istniejącego toru wybudowano drugi tor tzw. Linię Hutniczo-Siarkową, która biegnie od granicy państwa do huty Katowice.

Wieś położona jest przy drogach: krajowej Nr 74 Zamość-Hrubieszów-Zosin, powiatowej Miączyn-Grabowiec. Istnieje tutaj Ochotnicza Straż Pożarna, która funkcjonuje w Krajowym Systemie Ratowniczo-Gaśniczym.

Według stanu na dzień 31 grudnia 2004 roku wieś Miączyn liczyła 734 mieszkańców,natomiast na 31 grudnia 2005 roku 749 mieszkańców.

Obecnie miejscowość (stan na 12.02.2024 r.) liczy 563 mieszkańców.